Protein–RNA interactions for Protein: Q810A7

Ddx42, ATP-dependent RNA helicase DDX42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx42Q810A7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Ddx42Q810A7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx42Q810A7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Ddx42Q810A7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Ddx42Q810A7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Ddx42Q810A7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Ddx42Q810A7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ddx42Q810A7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx42Q810A7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx42Q810A7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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