Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttll4Q80UG8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttll4Q80UG8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttll4Q80UG8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttll4Q80UG8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttll4Q80UG8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttll4Q80UG8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ttll4Q80UG8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttll4Q80UG8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttll4Q80UG8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttll4Q80UG8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms