Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec18aQ7TSQ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec18aQ7TSQ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec18aQ7TSQ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec18aQ7TSQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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