Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sbno2Q7TNB8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno2Q7TNB8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sbno2Q7TNB8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sbno2Q7TNB8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms