Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RfflQ6ZQM0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RfflQ6ZQM0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RfflQ6ZQM0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RfflQ6ZQM0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms