Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ncapd3Q6ZQK0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ncapd3Q6ZQK0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms