Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88cQ6VGS5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms