Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smchd1Q6P5D8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smchd1Q6P5D8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smchd1Q6P5D8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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