Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retreg2Q6NS82 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retreg2Q6NS82 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retreg2Q6NS82 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retreg2Q6NS82 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms