Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep78Q6IRU7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep78Q6IRU7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cep78Q6IRU7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep78Q6IRU7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms