Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Brsk2Q69Z98 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brsk2Q69Z98 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brsk2Q69Z98 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1668.4 ms