Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Atg9aQ68FE2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atg9aQ68FE2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atg9aQ68FE2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg9aQ68FE2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms