Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BegainQ68EF6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BegainQ68EF6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BegainQ68EF6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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