Protein–RNA interactions for Protein: Q64096

Mcf2l, Guanine nucleotide exchange factor DBS, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcf2lQ64096 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mcf2lQ64096 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcf2lQ64096 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcf2lQ64096 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcf2lQ64096 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcf2lQ64096 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcf2lQ64096 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcf2lQ64096 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcf2lQ64096 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcf2lQ64096 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mcf2lQ64096 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mcf2lQ64096 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mcf2lQ64096 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcf2lQ64096 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mcf2lQ64096 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcf2lQ64096 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcf2lQ64096 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcf2lQ64096 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcf2lQ64096 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcf2lQ64096 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcf2lQ64096 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcf2lQ64096 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcf2lQ64096 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcf2lQ64096 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms