Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndufa4Q62425 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa4Q62425 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa4Q62425 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufa4Q62425 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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