Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tff3Q62395 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tff3Q62395 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms