Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sin3bQ62141 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms