Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Odf1Q61999 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf1Q61999 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms