Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Erbb3Q61526 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Erbb3Q61526 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Erbb3Q61526 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Erbb3Q61526 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Erbb3Q61526 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms