Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AcanQ61282 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AcanQ61282 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AcanQ61282 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AcanQ61282 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AcanQ61282 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AcanQ61282 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AcanQ61282 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AcanQ61282 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AcanQ61282 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AcanQ61282 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AcanQ61282 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms