Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vdac3Q60931 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vdac3Q60931 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vdac3Q60931 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vdac3Q60931 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms