Protein–RNA interactions for Protein: Q60675

Lama2, Laminin subunit alpha-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama2Q60675 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms