Protein–RNA interactions for Protein: Q60675

Lama2, Laminin subunit alpha-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama2Q60675 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lama2Q60675 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lama2Q60675 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama2Q60675 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lama2Q60675 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms