Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r195Q5SVD6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r195Q5SVD6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms