Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc1Q5NCF2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms