Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rtl5Q5DTT4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rtl5Q5DTT4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rtl5Q5DTT4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rtl5Q5DTT4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rtl5Q5DTT4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms