Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q504N7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q504N7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q504N7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q504N7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q504N7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q504N7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q504N7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q504N7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q504N7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q504N7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q504N7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q504N7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q504N7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q504N7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q504N7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q504N7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q504N7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q504N7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q504N7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q504N7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q504N7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q504N7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q504N7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q504N7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q504N7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q504N7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q504N7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q504N7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q504N7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q504N7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q504N7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q504N7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q504N7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q504N7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q504N7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q504N7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q504N7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q504N7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q504N7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q504N7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q504N7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q504N7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q504N7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q504N7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q504N7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q504N7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q504N7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q504N7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q504N7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q504N7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q504N7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q504N7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q504N7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q504N7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q504N7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q504N7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q504N7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q504N7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q504N7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q504N7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q504N7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q504N7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q504N7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q504N7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q504N7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q504N7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q504N7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q504N7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q504N7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q504N7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q504N7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q504N7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q504N7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q504N7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q504N7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q504N7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q504N7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q504N7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q504N7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q504N7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q504N7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q504N7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q504N7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q504N7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q504N7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q504N7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q504N7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q504N7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q504N7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q504N7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q504N7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q504N7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q504N7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q504N7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q504N7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q504N7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q504N7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q504N7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q504N7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms