Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Defa20Q45VN2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa20Q45VN2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.9 ms