Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Itga1Q3V3R4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itga1Q3V3R4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms