Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Obox3Q3UT54 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Obox3Q3UT54 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms