Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrch2Q3UMG5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lrch2Q3UMG5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrch2Q3UMG5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrch2Q3UMG5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrch2Q3UMG5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrch2Q3UMG5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrch2Q3UMG5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrch2Q3UMG5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrch2Q3UMG5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrch2Q3UMG5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrch2Q3UMG5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrch2Q3UMG5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrch2Q3UMG5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrch2Q3UMG5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms