Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB5

Smcr8, Guanine nucleotide exchange protein SMCR8, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smcr8Q3UMB5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smcr8Q3UMB5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smcr8Q3UMB5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smcr8Q3UMB5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smcr8Q3UMB5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smcr8Q3UMB5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smcr8Q3UMB5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smcr8Q3UMB5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smcr8Q3UMB5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smcr8Q3UMB5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smcr8Q3UMB5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smcr8Q3UMB5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms