Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc33Q3ULW6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc33Q3ULW6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc33Q3ULW6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc33Q3ULW6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms