Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm5113Q3UGK8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm5113Q3UGK8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5113Q3UGK8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm5113Q3UGK8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5113Q3UGK8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5113Q3UGK8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5113Q3UGK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5113Q3UGK8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5113Q3UGK8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5113Q3UGK8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm5113Q3UGK8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5113Q3UGK8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5113Q3UGK8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5113Q3UGK8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms