Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn7l3bQ3UD01 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn7l3bQ3UD01 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn7l3bQ3UD01 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atxn7l3bQ3UD01 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms