Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul4aQ3TCH7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul4aQ3TCH7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cul4aQ3TCH7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul4aQ3TCH7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms