Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc2Q3SXD3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms