Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp8Q2V6D6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gbp8Q2V6D6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gbp8Q2V6D6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp8Q2V6D6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms