Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp2Q08652 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbp2Q08652 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms