Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah2Q06986 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah2Q06986 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Siah2Q06986 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms