Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbp1Q01514 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbp1Q01514 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp1Q01514 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms