Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ext2P70428 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ext2P70428 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ext2P70428 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ext2P70428 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ext2P70428 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ext2P70428 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ext2P70428 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ext2P70428 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ext2P70428 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ext2P70428 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ext2P70428 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ext2P70428 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ext2P70428 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ext2P70428 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ext2P70428 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ext2P70428 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ext2P70428 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ext2P70428 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ext2P70428 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ext2P70428 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ext2P70428 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ext2P70428 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ext2P70428 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ext2P70428 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ext2P70428 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ext2P70428 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ext2P70428 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms