Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zic1P46684 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic1P46684 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic1P46684 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zic1P46684 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zic1P46684 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zic1P46684 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zic1P46684 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zic1P46684 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zic1P46684 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zic1P46684 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zic1P46684 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms