Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klf1P46099 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klf1P46099 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf1P46099 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klf1P46099 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klf1P46099 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klf1P46099 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klf1P46099 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms