Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TfamP40630 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TfamP40630 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TfamP40630 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TfamP40630 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TfamP40630 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TfamP40630 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TfamP40630 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TfamP40630 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TfamP40630 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TfamP40630 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TfamP40630 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TfamP40630 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TfamP40630 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TfamP40630 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TfamP40630 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TfamP40630 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TfamP40630 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TfamP40630 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TfamP40630 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TfamP40630 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TfamP40630 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TfamP40630 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TfamP40630 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TfamP40630 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TfamP40630 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TfamP40630 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TfamP40630 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TfamP40630 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TfamP40630 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TfamP40630 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TfamP40630 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TfamP40630 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TfamP40630 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TfamP40630 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TfamP40630 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TfamP40630 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TfamP40630 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TfamP40630 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TfamP40630 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TfamP40630 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TfamP40630 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TfamP40630 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TfamP40630 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TfamP40630 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TfamP40630 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TfamP40630 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TfamP40630 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TfamP40630 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TfamP40630 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TfamP40630 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TfamP40630 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TfamP40630 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TfamP40630 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TfamP40630 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TfamP40630 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TfamP40630 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TfamP40630 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TfamP40630 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TfamP40630 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TfamP40630 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TfamP40630 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TfamP40630 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TfamP40630 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TfamP40630 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TfamP40630 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TfamP40630 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TfamP40630 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TfamP40630 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TfamP40630 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TfamP40630 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TfamP40630 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TfamP40630 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TfamP40630 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TfamP40630 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TfamP40630 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TfamP40630 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TfamP40630 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TfamP40630 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TfamP40630 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TfamP40630 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TfamP40630 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TfamP40630 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TfamP40630 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TfamP40630 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TfamP40630 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TfamP40630 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TfamP40630 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TfamP40630 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TfamP40630 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TfamP40630 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TfamP40630 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TfamP40630 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TfamP40630 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TfamP40630 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TfamP40630 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TfamP40630 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TfamP40630 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TfamP40630 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TfamP40630 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms