Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ly6dP35459 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ly6dP35459 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ly6dP35459 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly6dP35459 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms