Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc11P31313 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc11P31313 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms