Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxa2P31245 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa2P31245 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa2P31245 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa2P31245 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa2P31245 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa2P31245 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa2P31245 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms