Protein–RNA interactions for Protein: P30549

Tacr2, Substance-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr2P30549 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tacr2P30549 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tacr2P30549 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tacr2P30549 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tacr2P30549 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tacr2P30549 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tacr2P30549 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tacr2P30549 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tacr2P30549 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tacr2P30549 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tacr2P30549 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tacr2P30549 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tacr2P30549 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tacr2P30549 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tacr2P30549 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tacr2P30549 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tacr2P30549 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tacr2P30549 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tacr2P30549 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tacr2P30549 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tacr2P30549 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tacr2P30549 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tacr2P30549 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr2P30549 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr2P30549 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr2P30549 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr2P30549 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr2P30549 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tacr2P30549 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr2P30549 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tacr2P30549 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tacr2P30549 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tacr2P30549 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms