Protein–RNA interactions for Protein: P30549

Tacr2, Substance-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr2P30549 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Tacr2P30549 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Tacr2P30549 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Tacr2P30549 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Tacr2P30549 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tacr2P30549 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Tacr2P30549 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Tacr2P30549 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tacr2P30549 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Tacr2P30549 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tacr2P30549 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tacr2P30549 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tacr2P30549 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tacr2P30549 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Tacr2P30549 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tacr2P30549 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Tacr2P30549 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Tacr2P30549 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Tacr2P30549 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tacr2P30549 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tacr2P30549 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tacr2P30549 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Tacr2P30549 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tacr2P30549 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tacr2P30549 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tacr2P30549 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tacr2P30549 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tacr2P30549 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tacr2P30549 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tacr2P30549 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tacr2P30549 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tacr2P30549 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Tacr2P30549 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tacr2P30549 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tacr2P30549 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tacr2P30549 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tacr2P30549 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tacr2P30549 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tacr2P30549 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tacr2P30549 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tacr2P30549 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tacr2P30549 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tacr2P30549 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tacr2P30549 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tacr2P30549 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tacr2P30549 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tacr2P30549 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tacr2P30549 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tacr2P30549 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tacr2P30549 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tacr2P30549 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tacr2P30549 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tacr2P30549 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tacr2P30549 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tacr2P30549 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tacr2P30549 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tacr2P30549 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Tacr2P30549 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tacr2P30549 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tacr2P30549 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tacr2P30549 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tacr2P30549 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tacr2P30549 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tacr2P30549 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Tacr2P30549 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tacr2P30549 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tacr2P30549 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tacr2P30549 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tacr2P30549 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tacr2P30549 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tacr2P30549 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tacr2P30549 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tacr2P30549 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tacr2P30549 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tacr2P30549 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tacr2P30549 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tacr2P30549 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tacr2P30549 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tacr2P30549 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tacr2P30549 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Tacr2P30549 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tacr2P30549 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tacr2P30549 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Tacr2P30549 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tacr2P30549 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tacr2P30549 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tacr2P30549 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tacr2P30549 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tacr2P30549 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tacr2P30549 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tacr2P30549 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tacr2P30549 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tacr2P30549 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tacr2P30549 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tacr2P30549 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tacr2P30549 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tacr2P30549 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tacr2P30549 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tacr2P30549 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tacr2P30549 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms