Protein–RNA interactions for Protein: P21658

Fgf6, Fibroblast growth factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf6P21658 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf6P21658 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgf6P21658 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgf6P21658 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms